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Mecanismo do anticorpo

Oct 15, 2023Oct 15, 2023

Nature Communications volume 14, Número do artigo: 1705 (2023) Citar este artigo

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Patógenos bacterianos desenvolveram mecanismos intrincados para escapar do sistema imunológico humano, incluindo a produção de enzimas imunomoduladoras. Os sorotipos de Streptococcus pyogenes secretam duas endo-β-N-acetilglicosaminidases multimodulares, EndoS e EndoS2, que desglicosilam especificamente o N-glicano conservado em Asn297 em IgG Fc, desativando as funções efetoras mediadas por anticorpos. Entre milhares de enzimas ativas de carboidratos conhecidas, EndoS e EndoS2 representam apenas um punhado de enzimas que são específicas para a porção de proteína do substrato de glicoproteína, não apenas o componente de glicano. Aqui, apresentamos a estrutura cryoEM de EndoS em complexo com o fragmento IgG1 Fc. Em combinação com espalhamento de raios X de baixo ângulo, mutagênese de varredura de alanina, medidas de atividade hidrolítica, cinética enzimática, ressonância magnética nuclear e análises de dinâmica molecular, estabelecemos os mecanismos de reconhecimento e desglicosilação específica de anticorpos IgG por EndoS e EndoS2. Nossos resultados fornecem uma base racional para projetar novas enzimas com seletividade de anticorpo e glicano para aplicações clínicas e biotecnológicas.

Streptococcus pyogenes (estreptococo do grupo A; GAS) é uma bactéria patogênica Gram-positiva que causa condições potencialmente fatais e doenças relacionadas ao sistema imunológico pós-infecção, além de infecções leves da pele e do trato respiratório superior1. A fim de escapar do sistema imunológico e facilitar a colonização do hospedeiro, o GAS emprega uma grande variedade de mecanismos, principalmente a secreção de enzimas que inativam seletivamente moléculas-chave do sistema imunológico, como os anticorpos imunoglobulina G (IgG) (Fig. 1a)2. EndoS3 e EndoS24 são endo-β-N-acetilglicosaminidases (ENGases) produzidas por diferentes sorotipos GAS que hidrolisam o N-glicano ligado a Asn297 na região do fragmento cristalizável (Fc) de anticorpos IgG. EndoS é secretado por vários sorotipos GAS, incluindo M1, enquanto EndoS2 é secretado exclusivamente pelo sorotipo M49 GAS4. Essas ENGases são os membros mais proeminentes de uma classe rara de enzimas ativas em carboidratos que são específicas para o componente proteico do substrato glicoproteico e não apenas para o componente glicano; nenhum mecanismo de especificidade proteica por esta classe de enzimas foi ainda descrito. O N-glicano ligado a Asn297 é necessário para a ligação de IgG aos receptores Fc γ (FcγRs) e complemento C1q, que desencadeiam funções efetoras mediadas por anticorpos5,6,7,8. A atividade dessas enzimas abole, assim, as funções efetoras mediadas pela região Fc dos anticorpos IgG, aumentando a sobrevida e a virulência da bactéria9. Consequentemente, as ENGases específicas de IgG demonstraram melhorar a doença autoimune em diversos modelos animais10,11,12,13. Além disso, EndoS e EndoS2 são ferramentas poderosas para a síntese quimioenzimática de anticorpos com glicoformas homogêneas14,15,16,17 e conjugados de drogas18,19. Os N-glicanos da região Fc de anticorpos IgG no soro são compostos por >33 glicoformas distintas20 e suas estruturas químicas únicas modulam as funções efetoras alterando a ligação de Fc a FcγRs, bem como a estabilidade e a meia-vida do anticorpo21. A terapêutica baseada em anticorpos, uma das classes mais proeminentes e em expansão de drogas usadas para o tratamento de diversos distúrbios humanos, incluindo câncer, autoimunidade e doenças infecciosas22, são produzidas com glicoformas heterogêneas que afetam sua segurança e eficácia21. EndoS e EndoS2 são particularmente úteis para a remodelação de Fc glicano devido à especificidade estrita de ambas as enzimas para anticorpos IgG intactos e à descoberta de seus respectivos mutantes de glicosintase que são capazes de transferir um N-glicano homogêneo para anticorpos IgG usando uma abordagem quimioenzimática23,24 ( Fig. 1b). A geração de anticorpos com glicoformas definidas é crítica não apenas para entender o papel de cada glicoforma na função do anticorpo, mas também para a produção de anticorpos com propriedades terapêuticas, diagnósticas e farmacocinéticas definidas25.

 1.5 was reached. Ampicillin (100 µg/mL) was used as selecting agent through the expression. Unless otherwise stated, bacteria were grown at 37 °C under shaking (220 rpm). Cells for inoculation of 10 mL M9+/D2O minimal medium with a starting OD600 of 0.1 were harvested by centrifugation, and excess of TB medium was removed. In all M9+/D2O minimal media, 3 g L−1 of 15N-ammonium chloride (Deutero) and 3 g L−1 of deuterated 12C-glucose (1,2,3,4,5,6,6-d7, Deutero) were used as the principal nitrogen and carbon sources, respectively. The next morning 2 mL of the starter culture were spin-down, supernatant was removed, and cells were transferred into 20 mL of freshly prepared M9+/D2O minimal medium. When an OD600 of 0.4 was reached, the culture volume was increased to 90 ml and cells were grown until an OD600 of 0.6–0.8 was reached. At this point, the temperature of the incubator was reduced to 16 °C and 10 mL of M9+/D2O minimal medium containing the desired labeled precursors and amino acids were added86. Amounts of isotopically labeled precursors for selective methyl labeling are given in Supplementary Table 4. Protein expression was induced with the addition of 1 mM or 0.5 mM isopropyl β-D-1-thio-galactopyranoside (IPTG) for EndoS2 or EndoBT constructs, respectively. Cells were harvested when the maximal cell density was reached and stored at -20 °C. Labeled protein was purified28,42 and stored at 4 °C./p>